本校は,鹿児島県本土のほぼまん中,ハイテクの街 霧島市の南東方向にあります。
市内とは言え,学校のまわりは,田や畑の多い農業地帯です。歩いて10分くらいで鹿児島湾(錦江湾)。すぐ東側には検校川(けんこうがわ),遠く北の方には霧島連山(きりしまれんざん)があり自然がいっぱいの土地です。
南小校区は平地部分と海抜200メートル前後の台地に大きく分かれますが,児童の大部分は,平地部分にすんでいます。国分平野全体が台地にかこまれていますが,南小のすぐ東側の台地には,有名な上野原遺跡が見つかりました。